也與日俱增。但他能在陳宣帝的外護之下，專修法華及般若三昧，終得六根清淨位。關於這點，《佛祖統紀》卷六，有如下的一段記載：「顗師問：『所證是十地耶？』曰：『吾一生望入銅輪（圓十住），以領徒太早，損己益他，但居鐵輪耳（師獲六根清淨，即是圓十信，別三十心，《華嚴》梵行、《瓔珞》鐵輪位也）。』」（註三二）
又在《法華傳記》中發現：「復悟法華三昧，大乘法門，境界明了，位至六根淨。」（註三三）
陳宣帝為表對於慧思禪師的優遇，特稱其為「大禪師」、「思大和尚」、「思禪師」之德號，即是根據以此。他在南嶽，一住就是十年，直到太建九年（西元五七七年），均在禪觀之靜思之中度過。他也就在那年的六月二十二日（註三四），以六十三歲的世壽入寂。他的弟子很多，著名者則有為首的智顗、僧照、大善、慧成、慧超、慧耀、慧涌、慧威、智瓘、慧命、玄光、慧璀，以及靈辯等諸龍象。
再講南嶽大師的著作，有文史可查的，有如下的多種記載：
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道宣撰《大唐內典錄》卷五（註三五）稱，共有八部十卷：
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《四十二字門》二卷。
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《無諍門》二卷。
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《隨自意三昧》一卷。
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《次第禪要》一卷。
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《釋論玄門》一卷。
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《三智觀門》一卷。
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《安樂行法》一卷。
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《弘誓願文》一卷。（「弘」字當係「立」字誤）
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《佛祖統紀》卷六（註三六）稱，共有九部十二卷，比《大唐內典錄》多了一部二卷的《大乘止觀》。
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日本傳教大師最澄（西元七六七～八二二年）的《臺州錄》（註三七）中，則說南嶽大師作有《發願文》、《安樂行》之外，尚有《受菩薩戒文》一卷。
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日本慈覺大師圓仁（西元七九一～八六三年）的《求法目錄》（註三八）則謂南嶽有《四十二字開義》、《無諍三昧》、《隨自意三昧》等。
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道宣的《續高僧傳》（註三九）卷一七，謂有七部九卷：
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《四十二字門》二卷。
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《無諍行門》二卷。
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《釋論玄》一卷。
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《隨自意》一卷。
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《安樂行》一卷。
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《次第禪要》一卷。
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《三智觀門》一卷。
《續高僧傳》與《大唐內典錄》，同為道宣一人所撰，也有詳略不同，《續高僧傳》比《大唐內典錄》少列了一種《立誓願文》。
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《景德傳燈錄》卷二七的「南嶽傳」（註四〇）中則謂有《四十二字門》及《無諍行門》各二卷，《釋論玄》、《隨自意》、《安樂行》、《次第禪要》、《三智觀門》者五部各一卷。合為七部九卷。
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島地大等氏的《天臺教學史》（註四一），除了以上所舉的以外，又加上《大乘入道章》一部二卷。其排列次序為：
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《大乘止觀法門》二卷。
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《四十二字門觀》二卷。
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《安樂行義》一卷。
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《立誓願文》一卷。
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《諸法無諍三昧法門》二卷。
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《三智觀門》一卷。
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《次第禪要》一卷。
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《釋論玄》一卷。
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《受菩薩戒文》一卷。（「文」字當係「儀」字誤）
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《大乘入道章》二卷。
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《隨自意三昧》一卷。
共計十一部十五卷，但是，現存者僅得其中的《立誓願文》、《諸法無諍三昧法門》、《安樂行義》、《大乘止觀法門》、《隨自意三昧》、《受菩薩戒儀》等六部八卷。但在大日本校訂大藏經《縮藏》陽帙第四卷，以及《大正》卷四六，均只收入其中的《大乘止觀法門》、《法華經安樂行義》、《諸法無諍三昧法門》、《南嶽思大禪師立誓願文》共四部六卷。因此若要研究現存的南嶽大師資料很少。正由於根據僅存的少數資料，來查考南嶽大師的著作，便發生了思想基礎上的不調和現象，特別對於《大乘止觀》這部書的作者問題，異論紛紜，迄今未能解決。此到後面再作詳細的探討吧。