白馬寺閱盡諸多王朝盛衰，飽經人間世態的滄桑，該寺也修廢頻仍，迭經成壞，歷朝亂世衰敗而治世必予重修，有清一代，即有順治四年（西元一六四七年）、康熙三十一年（西元一六九二年）及五十二年、五十五年、乾隆五十一年（西元一七八六年）、同治十三年（西元一八七四年），凡六次修復；民國二十一年（西元一九三二年）三月，國民政府擬遷都洛陽，中央委員張繼訪白馬寺，見到牆敗宇塌，庭階荒蕪，即請上海德浩法師駐錫此寺，重行營建。嗣以抗日戰爭中，白馬寺再度敗落，再加上文化大革命的徹底摧殘，佛像被砸，經卷被焚，法器被毀。一九七二年起，大陸責成文物保管所再次全面重修並經營管理，到了一九八四年，始移交洛陽巿「佛教協會」，由僧人管理。

現在所能見到的白馬寺，在其寺東一華里處有齊雲寺的密簷塔，據稱建於後唐莊宗，如今有塔而無寺。

白馬寺前左側有一石馬，原係位於寺西一千公尺處的宋代右衛將軍附馬都尉魏咸信墓前之物，民國二十四年（西元一九三五年）前後，德浩法師將之移於寺前，原有一對，現僅存其一匹。寺內則有天王殿、客堂、祖堂、齋堂、禪堂、大佛殿、大雄寶殿、接引殿、清涼臺、毘盧殿、迦葉摩騰殿、竺法蘭殿、上僧院（在清涼臺上的西院）、迦葉摩騰及竺法蘭的二大師墓。