是密宗的教義，依據《密宗道次第廣論》所示，次第修學，共分三個學級，修業的年限是依個人的勤奮、程度、能力而定。

續部上學院，也是密學院，研究密宗的教律，接受上師的灌頂口訣，修行密宗的儀軌，也分三個學級，學習年限不定。

喜金剛學院，主要研究密宗喜金剛的生起和圓滿次第之道，並且學習天文曆法、藏文文法、書法、音樂及護法舞蹈等。該學院是培養西藏民族文化人才的重要場所，也分三個學級，學習年限不定。

時輪學院，是藏密的最高層次，院內的僧侶，除學習與修觀有關的時輪密乘以外，還要研究天文曆算，也分三個學級，學年無嚴格規定。

醫藥學院，研究西藏的醫術和西藏的藥物。該院的僧侶除了學習一般的佛教經典外，主要是專門研習著名的藏醫著作︰《四部藥典》、《晶珠草本》、《月王藥珍》。在學期間，僧侶們接受智識的傳授之後，還要從事採藥及製藥等實習的工作。