院初建於西元一一七五年的高倉天皇時代，被指為淨土宗總本山則是西元一五二四年。先後受到嵯峨天皇、伏見法皇、將軍足利義政、後柏原天皇、慶秀權貴、後奈良天皇、織田信長、豐臣秀吉、德川家康等的幸臨及眷顧，他們蒞臨住宿之處，便是大小「方丈」，故有示警裝置的必要。日本寺院的「方丈」，是為高貴的俗人所住，「庫裡」則為住持的僧人所居，確有其道理，因為「方丈」的典故出於維摩詰居士，