法鼓山大學院教育體系，包括自北投中華佛教文化館搬遷上山的中華佛學研究所和二〇〇一年九月正式創辦的法鼓山僧伽大學佛學院。此外，我們的新學制「法鼓佛教研修學院」也於二〇〇六年正式獲教育部核准設立，二〇〇七年即可招生。法鼓佛教研修學院是全台灣第一所獲教育部通過成立的單一宗教研修學院，研究生畢業之後，可獲頒宗教碩士學位；這是我們努力了二十餘年，終於盼來的成果。法鼓大學工程也很有進展，不久即可招收第一屆學生。

大學院教育的一大特色，便是擁有先進、新穎的教學設施。例如二〇〇二年啟用的圖書資訊館，以豐富的佛學藏書，包括漢、藏、滿、巴、日、英、泰文等五十一套大藏經，和珍貴的緬甸貝葉寫本二百五十五函，