第三卷和第四卷分別說明宇宙及人生的形成、性質與現象，也就是宇宙觀和人生觀。

第五卷和第六卷，是佛的大弟子阿羅漢和菩薩們，在佛前述說自己最初是如何修行？如何得道？用的是什麼方法？證得什麼果位而得到圓滿通達？一共有二十五種圓通法門；第六卷則是介紹觀世音菩薩的耳根圓通法門，說明觀世音菩薩是如何用耳根聽聞佛法、廣度眾生，因而成就了三十二種化身。這二十五位成就了的聖者，都可以做為我們學習的典範。

第七卷則說出了〈楞嚴咒〉，共有四百三十九句，並且說明誦〈楞嚴咒〉的功德和功用。

第八卷分成上、下兩個方向來解釋，首先說明眾生要向上修行，應該要修三摩地，破種種顛倒妄見，經過五十七個菩薩階位，然後進入本元真如，終至成佛。五十七個階位，從乾慧地、十信、十住、十行、十迴向、暖、頂、忍、世第一，再加上十地、等覺，乃至妙覺等，一共五十七個；其次說明眾生向下，也就是墮落到地獄，有十種因、六種果，都是自己造業、自己感受差別的果報。

第九卷講的是「三界二十五有」的種種形象。「三界」指的是欲界、色界、無色界，「二十五有」是在三界之中，有二十五種類別的眾生，各有種種形象。