後醍醐天皇崩後,又得將軍足利尊氏及足利義直兩兄弟之皈仰,並且受足利尊氏之請,建天龍寺以追薦後醍醐天皇之冥福。他的國師號,即為後醍醐天皇所賜。其門下英才極多,嗣法者即有五十人以上,中以春屋妙葩、義堂周信、絕海牛津等,最為出色。
大燈國師(西元一二八二~一三三七年)號妙超,字宗峯,二十歲依佛國禪師出家,又入大應國師紹明之會下,參三年大悟而嗣其法。宗峯的禪風以峻嚴著稱,受花園及後醍醐兩天皇之皈依。當後醍醐天皇南遷吉野之後,宗峯即成為南朝的國師,而與北朝之師夢窗國師齊名。嗣法弟子之優秀者,為徹翁義亨及關山慧玄。
徹翁義亨,繼住宗峯所創的京都大德寺為第二代,第三代法孫則為一休宗純。
關山慧玄,奉花園上皇之命,將其離宮改為妙心寺,成為妙心寺第一代祖。此後的臨濟宗,即以妙心寺為主要中心而發展延伸,至其第六代法孫雪江宗深之門,便分出四派,此後遂為日本禪宗的最大主力。
五山十剎
臨濟宗各系法嗣相承,以京都及鎌倉為中心而極其繁榮。到將軍足利義滿時代(西元一三六八~一三九四年為其稟政期間),