大致上都維修得很好，沒有多少變動。

在靈巖山寺的歷代高僧，有名可查的，除了開山智積菩薩之外，尚有北齊慧曉禪師。唐朝有道鑒、道遵。宋朝有定慧、道光、圓照、慈受、佛海妙空、月林觀、隆興黃龍、無門慧開、破菴祖先。元朝有石湖至美、南堂清欲、大方、天彰文煥。明朝南石文琇、天際洪澤、戒雷道震、弘儲繼起、月函南潛、僧鑒曉青、山菴林。清朝有悟開，然後就是民國時代的聖量印光大師，別號常慚愧僧。

從以上靈巖山寺歷代高僧事蹟來看，只有到了清末民初，才從禪宗漸漸轉變為彌陀淨土的專修道場，在歷代禪宗人物之中，有不少位可在《高僧傳》中以及禪宗的《傳燈錄》中，看到他們的事蹟。譬如無門慧開禪師輯有《禪宗無門關》一書，直到現在，還受到中日兩國臨濟宗的普遍應用。