以如此單薄的身軀，即使大病不患，卻是小病不斷。不過，他每年以榮民身分到臺北榮總健康檢查時，醫師都說沒有心血管病和糖尿病；唯一的建議是「要多休息」。

確有不少信眾關心法師的健康，會送他一些高營養食品進補。他說，現代人對食物的講究也許食不厭精、燴不厭細；但從他早年對食物粗細毫無選擇餘地，經年累月的粗茶淡飯，至今如果吃營養一點，腸胃就會不習慣，反而是蕃薯葉、莧菜等，是他餐桌上常見的「美食」。

聖嚴指出，十年前，他應邀到新加坡弘法時，由於不適應當地的濕熱氣候，便得了熱症，因此返國後住院一週療養，成為他生平唯一住院的經驗；不過，感冒等小病卻經常纏身。但他表示，自己很少吃藥，一出現感冒症狀，只需禪坐十五分鐘，就會掃除身體不適。而且，他也常把禪坐當成平常睡眠不足的體力加油站。

提到禪坐的功效，聖嚴強調：「這是最佳的運動、健身及治病的養生方法」。理由是禪坐時，可藉身體姿勢和控制心智，達到「動中取靜，靜中取動」的效果。他認為禪坐時可調和體內的循環、呼吸和消化系統，並可調節新陳代謝的速度，不致過快或過緩，而且也可讓浮躁的心安靜、平穩下來。

他認為，心平氣和是追求健康的不二法門。當情緒過於波動時，如興奮、