由此可見，影響明末居士的佛教信仰及作為修持指導的經論，不論對於淨土行者或禪者，力量最大而主要的是《金剛經》，其次是《楞嚴經》。本來，這兩部經典，是屬於禪宗，五祖、六祖開始，以《金剛經》為依歸，唐末宋初開始，禪宗夾用教理，故對《楞嚴經》加以重視。明末的居士，以此二經為主，再以《法華經》、《阿彌陀經》、《華嚴經》為附，即形成一代佛教的思潮。也可見到，思想的中心，仍是禪的精神，此又可從雲棲祩宏主張參究念佛、居士們修行念佛三昧者竟有六人，得到旁證，證明當時的佛教是以淨土為目標，卻以禪理作指針的。至於天臺的法華、賢首的華嚴，並非思潮的主流，甚至僅與持〈準提咒〉的風尚相近。

另外從《居士傳》的記載中，一見或二見明末居士所用的經論語錄，則有《華嚴經》、《圓覺經》、《六祖壇經》、《觀音經》、《心經》、《大乘起信論》、《維摩經》、《梁皇寶懺》、《指月錄》、《宗鏡錄》、《五燈會元》、《阿彌陀經疏鈔》、《三千佛名經》、《四十二章經》、《佛遺教經》、《般若經》、〈大悲咒〉、〈往生咒〉、