長壽住世，竟「願以身代之」，這絕對不是一般客套的悼慰話了，上皇對於一位歸化的禪僧，如此真情相待，實在難得可貴。

接著亦由已經出家為尼的皇女林丘寺宮光子法內親王，提出奏請，後水尾法皇便對隱元禪師授給「大光普照國師」之謚號。敕文云：

朕聞臨濟之道，遍行天下，至天童雙徑，光輝益盛。唯我日域，久乏宗匠，幸黃檗隱元琦和尚，受請東來，重立綱宗，闡揚濟道，大光於國，功不可磨，朕屢沾法乳，簡在朕心，故

特賜大光普照國師之號，以旌厥德，欽哉，故諭。

寬文十三年四月三日

敕文中一則慨歎「唯我日域，久乏宗匠」，再則稱頌隱元禪師東來日本，「重立綱宗」，闡揚臨濟祖道，「大光於國。」此係指出日本禪宗此際已無大匠，故藉隱元東渡而重振臨濟宗風。以此可知，隱元禪師對於日本禪佛教的振興，厥功甚偉。縱然受到來自妙心寺保守派的許多抨擊，說他不識禮法，說他濫收徒眾，連馬伕船腳為了糊口，也到寺內剃度，數百惡比丘，都成了會眾。