「六入」就是眼耳鼻舌身意的六根，名為內六入；色聲香味觸法的六境，名為外六入，具名十二入，十二處。胎兒具足了六根，然後出生，即與六境相對緣塵，就有了「觸」。我們與環境接觸以後就會有「感受」：苦受、樂受、不苦不樂受等等。有了苦樂的感受就有了「愛」，「愛」即是愛樂；愛的相對就是恨，愛恨就是執著，有執著就產生「取」。因為「取」而「有」下一生的「無明」，這又成了業種。有業種就再產生行、識、名色，也就是「生」。「生」了以後，就必然有「老死」。

在這十二因緣裡，「名色」的「色」是物質，六入、有、生、老死都是物質和精神和合而成；其他都屬精神的，都是「心」。因此，無明是「心識」的根本，唯識是從無明開始，所以唯識的根源就是無明。

從十二因緣看，我們眾生的生死流轉，是以無明為主，所以無明是唯識的源頭。但是，十二因緣是從三世流轉來看的；如果從這一生來看，生命個體分成蘊、處、界三大科。蘊就是色、受、想、行、識五蘊，這裡的識還是指第六識，受、想是第六識的作用，行是介於心、色的一種勢力；受是苦、樂等受。想就是思想，遇到苦的、樂的會考慮要怎麼辦，接著就是要採取行動。