有著顯著的治療功效。

根據日本京都大學心理學教授佐藤幸治的禪坐研究報告指出，坐禪有十種心理方面的效果：1.忍耐心的增強，2.治療各種過敏性疾病，3.意志力的堅固，4.思考力的增進，5.形成更圓滿的人格，6.迅速的使頭腦冷靜，7.情緒的安定，8.提高行動的興趣和效率，9.使肉體上的種種疾病消失，10達到開悟的境地。

聖嚴法師認為，打坐能鍊身，是由於鍊心的緣故。鍊心又必須從克服身體上的痛、痠、麻三重障礙開始。所以除了有定時的放腿和各種伸展運動之外，嚴格要求坐姿的正確度，尤其要求以最大的耐力來接受腿部及背部等處痠痛的障礙。

而消除肉體障礙的基本方法也是用數息來集中心念。數息可以入定，可以忘卻身心。如果痛得無法數息時，聖嚴法師建議坐禪者，將心念集中在痛的感受上，將痛觀想成局部化，再觀想成客觀化。結果痛至極點，不是轉痛為涼就是由於心念集中而失去了痛的感受。聖嚴法師表示，禪眾即使無法接受腿痛來得到輕安的覺受，也能將意志薄弱者鍊成堅強，性情浮躁者鍊成穩重，缺乏自信心和自制者鍊成有自信心和自制力。

至於禪境的高低，聖嚴法師用四句話來形容：1.澄澄湛湛，2.光音無限，3.一片悟境，4.虛空粉碎。顯然地，前三境均非見性，尚未達到無念的程度，