要使政府與佛教打成一片，並不容易；然在君主權力至上的北族國家，把世間的皇帝，與出世間法的佛教，相互結合而無矛盾的情形，早在六朝時代，已經見到。

第四節 元朝對於佛教的統制

元世祖至元六年（西元一二六九年），設置總制院，作為處理佛教及西藏關係事務的機構，後又改稱宣政院。這一機構，直屬帝師，故對作為一般行政機構之核心的中書省而言，完全是獨立的。因此，帝師命令的行使，即具有和皇帝詔勅同樣的權威。宣政院的長官，稱為院使，定員兩名，必須由帝師推舉的僧人擔任。其下有同知、副使、參議等職，各為定員兩名，乃係採取僧俗併用的方針。後來，隨著帝室對於喇嘛教的優遇日隆，而將此一機構擴大，到了文宗天曆二年（西元一三二九年），院使的人數，已增至十名之多。

對於南宋的故土，江南地方，元世祖時，在杭州設置江南釋教總統所，以之統領其管內的教團，開始即以喇嘛擔任此一機構的長官，稱為總統。到成宗大德三年（西元一二九九年），即將此一機構，合併於原先的宣政院。文宗時代，實行統攝佛教的制度改革，在中央的宣政院之下，全國各地分設十六個廣教總管府，將佛教教團納入劃一統領的組織之內。此後不久，宣政院的舊規再度復活。